Dengan diperoleh sertifikasi ISO 9000 di seluruh Program Studi FT-UNY sejak 2008 maka pimpinan FT UNY berkomitmen penuh untuk melaksanakan dan memenuhi persyaratan ISO 9000 secara konsisten dan berkelanjutan. Dalam rangka memantau keterlaksanaan sistem manajemen mutu ISO 9000 di FT-UNY maka pada senin 14 Februari 2001 dilaksanakan Audit Internal untuk manajemen laboratorium di lingkungan FT-UNY. Pelaksanaan audit dibuka oleh Dr. Sudji Munadi selaku wakil manajemen (MR) didampingi Ketua Penjaminan Mutu FT UNY Basrowi, M.Pd.  Pelaksanaan audit ini melibatkan 8 auditor internal yang melakukan audit di 20an laboratorium yang ada di 6 Jurusan di lingkungan FT-UNY. melalui audit ini diharapkan pengelolaan laborarotorium lebih akuntable, sesuai prosedur mutu agar lebih efisien dan efektif guna pelayanan kegiatan pembelajaran. Internal Audit selain untuk memenuhi tuntutan ISO 9000 juga sangat berhubungan dengan Good Corporate Governance (GCG). Dengan diimplementasikan GCG dengan baik diharapkan berkorelasi positif terhadap kinerja FT-UNY. (noor)